复旦大学于1988年组建成人教育学院，是教育部部属院校中最早开展成人教育的院校之一。2000年，复旦大学与上海医科大学合并组建新的复旦大学，原两校的成人教育学院合并成立继续教育学院。
复旦大学始终将继续教育作为学校人才培养、对接国家战略，服务社会、服务经济发展的重要渠道。多年来，继续教育学院已形成了学历继续教育和非学历继续教育并重的办学格局，面向社会，依法办学，规范管理，学生为本、质量为重、服务为先，为广大社会成员提供更新知识、拓展技能、提高素质的有效途径。
高等学历继续教育依托复旦大学学科专业优势与师资课程资源优势，拥有经管、文史、法学、理工、医学等五大类47个专业，夜大学在校学生七千余名，已培养各层次毕业生6.3万人。
此外作为上海市高等教育自学考试的主考学校，目前开考行政管理学、护理学、新闻学等若干专业。
非学历继续教育主要开展各类干部教育培训项目和医学继续教育项目。